Estabeleceu-se por longa data em Lisboa como farmacêutico, tendo botica no largo do Poço Novo. Segundo Inocêncio, Caetano José de Carvalho teria se envolvido com uma senhora de elevado nascimento, origem de graves perseguições que o levaram a ser várias vezes preso, sob pretexto político, nas cadeias da cidade. Morreu na torre de São Julião da Barra em 24 de março de 1830, onde estava preso desde 24 de maio de 1829. Conforme as informações colhidas por Inocêncio, teria morrido com mais de 50 anos de idade.
